教育部和国务院学位委员会批准并公布了2010年全国优秀博士学位论文名单（教研[2010]3号），共评出100篇“全国优秀博士学位论文”和334篇“全国优秀博士学位论文提名论文”。由我院上海兽医研究所所长童光志研究员指导的2005级博士研究生于海的博士学位论文《中国部分地区猪流感病毒的分子流行病学研究》获得了2010年全国优秀博士学位论文，我院作物科学研究所何中虎研究员指导的2005级博士研究生何心尧的博士学位论文《普通小麦及其近缘种籽粒多酚氧化酶活性与黄色素含量相关基因的克隆与功能标记开发》获得了2010年全国优秀博士学位论文提名。

为了不断提高我院博士研究生学位论文质量，激励博士研究生开展原创性研究工作，近年来，研究生院先后制定并实施了《中国农业科学院优秀博士学位论文评选及奖励办法》和《中国农业科学院优秀博士学位论文培育计划》，这些举措的出台，极大地调动了学生深入开展创新研究的积极性，活跃了研究生学习和从事科研工作的氛围，提高了我院博士学位论文的整体水平，取得了一些令人可喜的成绩。