中国农业科学院研究生院的院徽由“汉印农字图案”为核心，加中英文校名组成。

选取汉代古印“农”字，造型端庄稳重，结构严谨，笔画间疏密有致，古朴雄浑，既体现了中国农业及农业科技悠久的发展史和丰富的文化内涵，也突出强调了中国农业科学院研究生院作为国家级高层次农业人才培养基地的主流地位。

“农”字内涵丰富而深远，集中表达了大农业的整体概念。该“农”字由上下两大部分组成：其中上半部分为两个“人”面向“田”作业的图案形成的象形文字，形象地表达了中国传统农业的耕作形态与其中的协作精神；下半部分为“辰”字：既寓意辰时（上午七点至九点），又代表日子和时光，揭示了农业与季节、时辰、天气等客观因素的紧密关系，也有珍惜光阴、勤奋作业的警世鞭策之意。结合中国农业科学院研究生院的发展目标和教学科研的具体情况，其中包含的勤奋刻苦、脚踏实地、只争朝夕与团结协作精神，具有十分隽永而深远的现实意义。 

由此“农”字构成的视觉符号，在整体上表达了大农业的宏观概念之同时，其部分笔画也形象地呈现了英文字母E (education教育/Excellent优秀的、卓越的）、W (World世界的)、H (High高端的、高等的)、F (Farming农业、农事/Food食物、食品－民以食为天）

对应地表示研究生院作为高等农业教育机构的性质、地位、任务和国际化发展目标。

整体标志为圆形，而其中的核心图案的“农”字为方形，体现了“天圆地方”，“天地相合”的传统思想；整齐的直线与圆润曲线之间形成了动静有致的对应关系，以乾坤概念反映了“天行健，君子以自强不息；地势坤，君子厚德以载物”的朴素哲学思想；同时，也寓意中国农业科学院研究生院严谨、务实的治学理念和规范的管理作风，象征勃勃的发展生机和广阔的发展出前景。